本发明公开了玉米功能菌粮的制备方法，包括：步骤一、将100重量份的玉米洗净，浸泡，过滤，向滤上物中加入7‑8重量份的南瓜果肉粉、2‑2.6重量份的南瓜籽皮粉、0.15‑0.2重量份的七水硫酸镁和0.08‑0.14重量份的磷酸二氢钾，调节含水量为55‑65％，高压灭菌，冷却，得固体培养基；步骤二、向固体培养基中加入5‑10重量份的液体活化食用菌菌种，搅均后，培养7‑12d，取出，得发酵培养基；步骤三、将发酵培养基干燥，粉碎，即得；以及，用上述玉米功能菌粮制备方法制备的玉米菌粮。本发明的制备方法简单，生产周期短，且制得的玉米菌粮的赖氨酸、色氨酸和可溶性膳食纤维含量显著提高，口感细腻，滋、气味佳。