本发明提供了一种从紫皮石斛原料中同时制备花色苷及多糖的方法，所述方法包括以下步骤：1)制备水提液：将新鲜紫皮石斛茎条在水中煎煮，并进行固液分离，所得液体为水提液；2)浓缩水提液：将水提液蒸发，得到浓缩水提液；3)提取多糖：将乙醇加入浓缩水提液中，静置后进行固液分离，所得固体干燥即为多糖；4)提取花色苷：将步骤3)固液分离所得液体去除乙醇后，再将溶液干燥即得花色苷。所述方法能够简便地将紫皮石斛中的花色苷色素和有功能活性的多糖同时分别提取出，并且得到的花色苷色素和多糖纯度较高；提取过程中能耗较低；该方法既可以提高时效，也可以充分利用资源，具有较好的应用前景。